Учёные описали «средний» геном: 5,3 млн отличий от эталона
Учёные из Медицинской школы Университета Эксетера составили наиболее полное описание «среднего» человеческого генома, проанализировав данные полного чтения генетического кода почти 900 тысяч взрослых участников британского проекта UK Biobank и американской программы All of Us. Типичный геном отличается от стандартной эталонной последовательности примерно в 4,3–5,3 миллиона точек.
Подавляющее большинство этих отличий распространено в популяции, находится вне границ генов и не оказывает измеримого влияния на здоровье. Лишь около 1,5% всех различий относятся к редким. В среднем человек несёт около 229 генетических вариантов, способных нарушить работу гена, хотя с высокой достоверностью подтверждены лишь 72% из них.
Среди генов, связанных с моногенными наследственными заболеваниями, у каждого найдётся от 1 до 3 вариантов, которые международная база ClinVar классифицирует как патогенные или вероятно патогенные. Большинство из них — единственная копия при рецессивных состояниях, то есть человек остаётся здоровым носителем. Ещё около 50 вариантов в каждом геноме имеют неясное значение.
По анализу 2334 пар родителей и детей каждый человек получает около 61 новой мутации плюс ещё две, формирующиеся на ранних этапах развития эмбриона. От 75% до 80% прослеживаемых новых мутаций происходят от отца: каждый год отцовского возраста в момент зачатия добавляет примерно 1,2 мутации, материнского — 0,4.
При оценке риска 28 распространённых заболеваний средний участник попал в топ-10% примерно по трём из них. Примерно каждый пятый в европейской популяции и каждый третий в других группах набрали максимальный балл хотя бы по одному заболеванию; разрыв авторы связывают с тем, что алгоритмы рассчитывались на выборке европейцев. Профессор Кэролайн Райт подчёркивает: генетическая вариативность — норма, а набор мутаций, связанных с болезнями, не гарантирует их проявления, поэтому тестирование и скрининг должны учитывать симптомы, семейный анамнез и другие клинические факторы.